Обучение в «Школе Наследие» базируется на классической программе «Школа России». Кроме того, учителя, реализуя идивидуальный подход в рамках группового обучения, используют лучшие методики других образовательных программ. В частности  - систему «Школа 2100».  Это опыт создания целостной образовательной модели, последовательно предлагающей непрерывное обучение детей от младшего дошкольного возраста до окончания старшей школы. Среди предметов, предложенных младшеклассникам для изучения, значатся:

• русский язык;
• литературное чтение;
• математика;
• английский язык;
• информатика;
• логика;
• ИЗО;
• музыка;
• основы светской этики;

Система построена таким образом, чтобы научить ребенка самостоятельно учиться, анализировать, систематизировать и применять знания на практике. При этом на каждом этапе учитываются возрастные особенности учеников. Согласно экспертизе РАО (Российской академии образования), модель “Школа 2100” полностью соответствует Федеральным образовательным стандартам.